科研成果

2019年6月6日，Journal of Experimental Botany在线发表了公司棉花生物学国家重点实验室/植物逆境生物学重点实验室宋纯鹏教授为通讯作者的研究论文“Transcriptome-wide analysis of pseudouridylation of mRNA and non-coding RNAs in Arabidopsis”。

假尿苷修饰（pseudouridylation，Ψ）广泛存在于酵母及哺乳动物的mRNA及多种非编码RNA中，Ψ是尿苷（U）的异构化产物。然而，关于RNA特别是植物mRNA中的Ψs仍知之甚少。该研究通过假尿苷测序，首次在拟南芥mRNA中鉴定到Ψ位点，同时检测到了其他非编码RNA中的Ψ位点。研究发现，三联体密码子第一位的U更容易被假尿苷化；位于mRNA 3'非编码区的U与5'非编码区和编码区的U相比有较少的异构化修饰；编码苯丙氨酸的密码子UUC最容易被假尿苷化；假尿嘧啶合酶SVR1基因缺失会导致叶绿体23S、16S和4.5S rRNA中一些Ψ修饰的减少，突变体中许多质体核糖体蛋白和光合作用相关蛋白显著减少。

该研究结果为拟南芥RNAs的假尿苷图谱和SVR1的生物学功能提供了新的见解，将为进一步利用Ψ修饰以调控植物基因表达和蛋白质生物合成奠定了基础。

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https://academic.oup.com/jxb/advance-article/doi/10.1093/jxb/erz273/5512449